GitHub Copilot カスタムインストラクション完全ガイド【2026年2月最新】設定方法・料金・ベストプラクティス¶
この記事の対象者
- Copilotを初めて設定するチーム 〜 既存設定を体系的に見直したい方
この記事の読み方¶
| 目的 | 読むセクション |
|---|---|
| 初めて設定する | 実装方法(Step 1-3) → チェックリスト |
| 体系を理解したい | インストラクション体系の全体像 → 設計パターン |
| 設定リファレンスを確認 | VS Code設定 ・ YAML Frontmatter |
| トラブルシューティング | よくある問題 ・ FAQ |
⚡ 5分で始めるクイックスタート
# 1. ディレクトリとファイルを作成
mkdir -p .github && touch .github/copilot-instructions.md
# 2. 最小限のインストラクションを記述
cat << 'EOF' > .github/copilot-instructions.md
# プロジェクト開発ガイドライン
- TypeScript strict モードを使用
- テストは必ず作成
- エラーハンドリングを必ず実装
EOF
# 3. コミットして共有
git add .github/copilot-instructions.md
git commit -m "Add Copilot custom instructions"
検証: VS Code Copilot Chatで質問 → 「References」に .github/copilot-instructions.md が表示されれば成功
この記事のポイント¶
AI支援の個別最適化
プロジェクト固有のルールでCopilotを効果的に誘導
チーム開発の一貫性
共通ガイドラインによる品質とスタイルの統一
開発効率の向上
繰り返し説明不要で的確なコード生成を実現
ドキュメント駆動開発
人間とAI両方が参照できる明確な指針
🗺️ インストラクション体系の全体像¶
GitHub Copilotのインストラクションは4つの階層 + 2つの拡張仕組みで構成されています。本記事はこの中の「Repository-wide」と「Path-specific」を中心に解説します。
graph TB
P["<b>1. Personal</b>(個人設定)<br>VS Code / GitHub.com のユーザー設定"]
O["<b>2. Organization</b>(組織ポリシー)<br>Business/Enterprise の管理者設定"]
R["<b>3. Repository-wide</b>(リポジトリ全体)<br><code>.github/copilot-instructions.md</code>"]:::focus
PA["<b>4. Path-specific</b>(パス別)<br><code>.github/instructions/*.instructions.md + applyTo</code>"]:::focus
P --> O --> R --> PA
SK["<b>Agent Skills</b>(オンデマンド起動)<br><code>.github/skills/<name>/SKILL.md</code>"]:::ext
AG["<b>AGENTS.md</b>(クロスツール統一管理)<br>プロジェクトルートの AGENTS.md"]:::ext
R -.- SK
R -.- AG
classDef focus fill:#e1f5fe,stroke:#0288d1,stroke-width:2px
classDef ext fill:#fff3e0,stroke:#f57c00,stroke-width:2px,stroke-dasharray:5 5本記事の対象範囲
上図で青色ハイライトされている 3. Repository-wide と 4. Path-specific を中心に解説します。 拡張仕組みの詳細: Agent Skillsガイド ・ AGENTS.md統一管理ガイド
| 仕組み | 適用タイミング | 典型的な用途 |
|---|---|---|
| copilot-instructions.md | 常時(全リクエスト) | コーディング規約、技術スタック |
| .instructions.md + applyTo | ファイルパスが一致したとき | フロント/バックエンド別ルール |
| Agent Skills | エージェントが必要と判断したとき | Terraformレビュー手順、リリース手順 |
| AGENTS.md | エージェント起動時 | プロジェクト全体の方針(マルチツール共通) |
使い分けの原則
- 常に適用したいルール → copilot-instructions.md / .instructions.md
- 特定タスクでだけ必要な手順 → Agent Skills
- 複数AIツールで共通化したい → AGENTS.md
- 詳細な比較: applyToパターンガイド
📖 GitHub Copilotカスタムインストラクションとは¶
GitHub Copilotカスタムインストラクションは、2024年に本格的に実用化された機能で、プロジェクト固有の開発方針やコーディング規約をCopilotに事前に伝える仕組みです。これにより、毎回詳細な指示を与えることなく、プロジェクトに適したコード生成や提案を受けられます。
指示ファイルは"AIのREADME"だ
2025-2026年の主要アップデート(クリックで展開)
機能追加:
- Agent Mode (2025年2月発表・2025年4月全ユーザー展開) - マルチファイル編集・テスト実行・検証を自動化
- 複数.instructions.md対応 (2025年7月) - YAML Frontmatterでパス別インストラクション
- Copilot Spaces (2025年9月24日GA) - コード・ドキュメント・ノートを統合管理
- Agent-Specific Instructions (2025年11月) - excludeAgentプロパティで特定エージェントへの適用制御
- Code Review統合 - コードレビューでもcopilot-instructions.md対応
モデル:
- 最新対応モデル: Claude Opus 4.6(2026年2月5日GA、1Mトークン)、GPT-5.1シリーズ、Gemini 3 Pro — 対応モデル一覧
- 2026年2月17日に Claude 3系・GPT-4系の一部が提供終了予定 — GitHub Changelog
料金・プラン: GitHub Copilot総合ガイドを参照
主な機能¶
.github/copilot-instructions.mdによるリポジトリレベルの統一ルール.instructions.md+applyToによるファイル別適用- VS Code、Visual Studio、JetBrains IDEs、Neovim、GitHub.com、GitHub Mobile、GitHub CLIで利用可能
- Copilot Code Reviewでも同じインストラクションを活用
🎯 コンテキストサイズとファイル設計のベストプラクティス¶
関連記事
「なぜ簡潔に保つべきか」の技術的根拠(System Prompt注入の仕組み)は 注入メカニズム解説【図解】 で図解しています。
ファイルサイズの制約と推奨事項¶
GitHub Copilotは新AIモデル(GPT-5.1、Claude Opus 4.6、Gemini 3 Pro)により拡張されたコンテキストウィンドウを持ちますが、カスタムインストラクションファイル自体は簡潔に保つことが重要です。
絞るほど精度が上がる
ファイルサイズに関する重要な指針
カスタムインストラクションファイルに大量のコンテキストを直接記述することは推奨されません。代わりに、外部ドキュメントへの参照パターンを活用することで、効率的な運用が可能になります。
推奨されるアプローチ¶
# ❌ 非推奨: 大量のコンテキストを直接記述
コーディング規約:
1. 変数名は camelCase を使用
2. 関数名は動詞から始める
3. クラス名は PascalCase を使用
4. インデントはスペース2文字
5. 文字列リテラルはダブルクォート
6. セミコロンは省略しない
... (大量の詳細規約が続く)
# ✅ 推奨: 参照パターンを活用
コーディング規約は [coding-standards.md](/generative-ai/github-copilot/docs/coding-standards/) を参照してください。
デバッグ手順は [debugging-guide.md](/generative-ai/github-copilot/docs/debugging-guide/) に従って実施してください。
API設計方針は [api-design.md](/generative-ai/github-copilot/docs/api-design/) を確認してください。
🚀 2025年新機能対応の実装方法¶
Before / After: インストラクション設定の効果¶
# Copilotがデフォルトで生成するコード例
def get_user(id):
query = f"SELECT * FROM users WHERE id = {id}" # SQLインジェクション脆弱性
result = db.execute(query)
return result
def get_user(user_id: int) -> User | None:
"""指定IDのユーザーを取得する。"""
return db.session.get(User, user_id) # ORM使用、型ヒント完備
Step 1: 基本ファイル作成(即座に開始可能)¶
# 1. 基本ディレクトリ作成
mkdir -p .github/instructions
# 2. メインインストラクションファイル作成
touch .github/copilot-instructions.md
# 3. 専用インストラクションファイル作成(2025年7月の新機能)
touch .github/instructions/frontend.instructions.md
touch .github/instructions/backend.instructions.md
touch .github/instructions/testing.instructions.md
Step 2: ファイル構成(2025年推奨)¶
project-root/
├── .github/
│ ├── copilot-instructions.md # メインのカスタムインストラクション
│ ├── instructions/ # 🆕 複数インストラクション対応
│ │ ├── frontend.instructions.md # フロントエンド専用指示
│ │ └── backend.instructions.md # バックエンド専用指示
│ ├── agents/ # 🆕 エージェント定義 (2025年新機能)
│ │ ├── test-agent.agent.md # テスト専用エージェント
│ │ └── docs-agent.agent.md # ドキュメント生成エージェント
│ └── skills/ # 🆕 Agent Skills (2025年12月〜)
│ └── terraform-plan-review/
│ └── SKILL.md # オンデマンド起動の手順知識
├── AGENTS.md # 🆕 AIエージェント向け統一命令
├── docs/
│ ├── coding-standards.md # 詳細なコーディング規約
│ └── ...
└── README.md
AGENTS.md について
AGENTS.md は、Linux Foundation / Agentic AI Foundation が策定したオープン標準で、GitHub Copilot・Claude Code・Cursor・Gemini CLI など複数のAIツールで共通利用できるプロジェクト命令ファイルです。
VS Code での有効化:
{
"chat.useAgentsMdFile": true,
"chat.useNestedAgentsMdFiles": true
}
copilot-instructions.md との使い分け:
- copilot-instructions.md: GitHub Copilot専用、常時適用
- AGENTS.md: マルチツール共通、エージェント起動時に参照
→ 詳細: AGENTS.mdクロスツール統一管理ガイド
Agent Skills について
Agent Skills は、SKILL.md + 補助リソースをフォルダにまとめた「手順知識パッケージ」です。.github/skills/ に配置すると、エージェントが必要なときだけ読み込んで作業精度を上げます。
copilot-instructions.md / .instructions.md が「常時適用のルール」なのに対し、Skills は「条件一致時にオンデマンド起動する専門能力」という位置づけです。
Step 3: YAML Frontmatter活用(2026年2月版・互換性重視)¶
VS Code と GitHub.com での違い
- VS Code:
name/description/applyToを UI表示・選択性のメタとして活用可能 - GitHub.com: 主に
applyToとexcludeAgentを参照 applyToの複数指定はカンマ区切り推奨(GitHub Docs準拠)
frontend.instructions.md の例:
---
# VS Code では name/description も活用可能(任意)
name: "Frontend instructions"
description: "React/TypeScript の実装ルール(UI/状態管理/命名など)"
# 適用範囲(GitHub Docs の説明に寄せてカンマ区切り推奨)
applyTo: "src/components/**/*.ts,src/components/**/*.tsx"
# 任意: 特定のエージェントには適用しない(例)
# excludeAgent: "code-review"
---
# フロントエンド開発指示
## React コンポーネント作成時
- TypeScript strict モードを使用
- React Hooks の依存配列を必ず指定
- コンポーネント名は PascalCase を使用
## スタイリング
- Tailwind CSS を使用(inline styles は避ける)
- レスポンシブ対応を必ず実装
backend.instructions.md の例:
---
# VS Code では name/description も活用可能(任意)
name: "Backend instructions"
description: "Node.js/Express バックエンド開発指示"
# 適用範囲(カンマ区切り)
applyTo: "src/api/**/*.js,src/api/**/*.ts"
# 任意: 特定のエージェントには適用しない
# excludeAgent: "code-review"
---
# バックエンド開発指示
## API エンドポイント作成時
- Express Router を使用
- エラーハンドリングを必ず実装
- OpenAPI 3.0 仕様に準拠
applyTo の指定方法
- glob パターンで、複数指定はカンマ区切り
excludeAgentで特定エージェント(coding-agent、code-reviewなど)への適用を除外可能
🤖 Copilot Chatによるインストラクション生成支援¶
手動でのインストラクション生成・改善¶
Copilot Chatを活用して、カスタムインストラクションの作成や改善の提案を受けることができます。
# 1. カスタムインストラクションの生成を依頼
# Copilot Chatで以下のプロンプトを実行:
"@workspace Generate custom instructions for this repository based on the current codebase"
# 2. 既存インストラクションの改善提案
"@workspace Review and suggest improvements for our copilot-instructions.md"
# 3. 特定の領域に特化したインストラクション生成
"Generate .instructions.md for frontend development based on our React components"
メインインストラクションファイルの構成例(2025年ベストプラクティス)¶
# プロジェクト開発ガイドライン
## 🏗️ 技術スタック
- **フロントエンド**: Next.js 14 + TypeScript + Tailwind CSS
- **バックエンド**: Node.js + Express + Prisma ORM
- **データベース**: PostgreSQL
- **テスト**: Jest + React Testing Library
- **パッケージマネージャー**: pnpm(npm/yarn使用禁止)
## 📝 コーディング規約(重要)
- JavaScript/TypeScriptは **ダブルクォート** + **タブインデント**
- 変数・関数名: camelCase
- コンポーネント名: PascalCase
- 定数: UPPER_SNAKE_CASE
## 🔗 詳細ドキュメント参照
詳細な情報は以下のドキュメントを参照:
- [コーディング規約詳細](/generative-ai/github-copilot/docs/coding-standards/)
- [API設計指針](/generative-ai/github-copilot/docs/api-design/)
- [テスト戦略](/generative-ai/github-copilot/docs/testing-strategy/)
## ⚙️ 開発フロー
1. 機能実装前に設計ドキュメント確認
2. TypeScript strict モードで実装
3. 必ずテストを作成
4. ESLint + Prettier でコード整形
📋 実装チェックリスト(即座に始められる)¶
✅ 基本セットアップ(5分で完了)¶
# 1. ファイル作成
mkdir -p .github/instructions
echo "# プロジェクト開発ガイドライン" > .github/copilot-instructions.md
# 2. 基本内容追加
cat << EOF >> .github/copilot-instructions.md
## コーディング規約
- JavaScript/TypeScriptはダブルクォート使用
- インデントはタブまたはスペース2文字
- 変数名: camelCase、コンポーネント名: PascalCase
## 必須実装事項
- TypeScript strict モード使用
- エラーハンドリング必須実装
- テストコード作成必須
EOF
# 3. Git追加・コミット
git add .github/copilot-instructions.md
git commit -m "Add Copilot custom instructions"
✅ 効果確認方法¶
- VS Code Copilot Chat や GitHub.com Chat で質問
- References セクションに
.github/copilot-instructions.mdが表示されるか確認(適用された証拠) - 生成されるコードが指示通りになっているか検証
- 注意: コード補完(インライン候補)にはカスタムインストラクションは適用されない
💡 効果的なインストラクション設計パターン¶
1. レイヤード参照パターン¶
# 段階的な詳細レベルの提供
## レベル1: 即座に必要な情報
- 使用技術: React 18 + TypeScript + Vite
- パッケージマネージャー: pnpm(npm/yarnは使用禁止)
- コードフォーマッター: Prettier + ESLint
## レベル2: 詳細ガイドライン
- 詳細なコーディング規約: [docs/detailed-coding-standards.md](/generative-ai/github-copilot/docs/detailed-coding-standards/)
- アーキテクチャ設計: [docs/architecture-guide.md](/generative-ai/github-copilot/docs/architecture-guide/)
## レベル3: 特殊ケース対応
- パフォーマンス最適化: [docs/performance-guide.md](/generative-ai/github-copilot/docs/performance-guide/)
- セキュリティガイドライン: [docs/security-guidelines.md](/generative-ai/github-copilot/docs/security-guidelines/)
2. 役割別インストラクション¶
# 役割に応じた指示の分離
## フロントエンド開発
フロントエンド開発の詳細は [./instructions/frontend.instructions.md](/generative-ai/github-copilot/instructions/frontend.instructions/) を参照
# Copilot Chatで参照する場合: #file で指定可能
## バックエンド開発
バックエンド開発の詳細は [./instructions/backend.instructions.md](/generative-ai/github-copilot/instructions/backend.instructions/) を参照
# Copilot Chatで参照する場合: #file で指定可能
## DevOps・インフラ
DevOps関連の詳細は [./instructions/devops.instructions.md](/generative-ai/github-copilot/instructions/devops.instructions/) を参照
# Copilot Chatで参照する場合: #file で指定可能
3. コンテキスト分離パターン¶
# プロジェクト固有の短期コンテキスト
- 現在のスプリント目標: 認証機能の実装
- 優先対応バグ: [docs/current-issues.md](/generative-ai/github-copilot/docs/current-issues/)
# 長期的なプロジェクト方針
- プロダクト戦略: [docs/product-strategy.md](/generative-ai/github-copilot/docs/product-strategy/)
- 技術的負債対応: [docs/technical-debt.md](/generative-ai/github-copilot/docs/technical-debt/)
🛠️ 実践的な運用例¶
新人エンジニア対応を想定した設計¶
「優秀な新人エンジニアが来た時に、プロジェクトの背景・開発方針・デバッグ手順がすぐ分かる」ことを前提に設計するのがポイントです。
# 新人エンジニア向けオンボーディング
## 🚀 最初に読むべきドキュメント
1. [プロジェクト概要](/generative-ai/github-copilot/docs/project-overview/) - 10分で理解できるプロジェクト全体像
2. [開発環境構築](/generative-ai/github-copilot/docs/setup-guide/) - 環境構築の完全手順
3. [コーディング規約](/generative-ai/github-copilot/docs/coding-standards/) - 最低限守るべきルール
## 🔧 日常開発で参照するドキュメント
- [デバッグ手順](/generative-ai/github-copilot/docs/debugging-guide/) - 問題発生時の調査方法
- [テスト実行方法](/generative-ai/github-copilot/docs/testing-guide/) - ローカル・CI両方のテスト手順
- [リリース手順](/generative-ai/github-copilot/docs/release-process/) - デプロイとリリースの流れ
## 💬 質問・相談時の参考
- [FAQ](/generative-ai/github-copilot/docs/faq/) - よくある質問と回答
- [トラブルシューティング](/generative-ai/github-copilot/docs/troubleshooting/) - 既知の問題と解決策
チーム開発での実装例¶
# チーム開発ガイドライン
## 🔄 開発フロー
1. 機能実装前: [機能設計テンプレート](/generative-ai/github-copilot/docs/templates/feature-design/)を作成
2. コード実装: [コーディング規約](/generative-ai/github-copilot/docs/coding-standards/)に従う
3. テスト作成: [テスト戦略](/generative-ai/github-copilot/docs/testing-strategy/)に基づく
4. レビュー依頼: [レビューガイドライン](/generative-ai/github-copilot/docs/review-guidelines/)を確認
## 🚨 緊急時対応
- 本番障害: [インシデント対応手順](/generative-ai/github-copilot/docs/incident-response/)
- セキュリティ問題: [セキュリティ対応手順](/generative-ai/github-copilot/docs/security-incident/)
📝 具体的な記述例とアンチパターン¶
✅ 推奨される記述例¶
# 効果的なインストラクション例
## 技術選択の指示
- データベースクエリには Prisma ORM を使用(生SQLは避ける)
- 状態管理は Zustand を使用(Redux は使わない)
- UI コンポーネントは shadcn/ui をベースに実装
## ファイル出力の指示
- 必ず対象ファイル名を明記してコードを出力する
- 複数ファイルの変更が必要な場合は、ファイルごとに分けて表示
## エラー対応の指示
- 不明な点がある場合は推測ではなく明確に質問する
- エラー発生時は [デバッグガイド](/generative-ai/github-copilot/docs/debugging-guide/) の手順に従う
## 参照ドキュメント
- 詳細なAPI仕様: [api-spec.yaml](/generative-ai/github-copilot/docs/api-spec.yaml)
- デザインシステム: [design-system.md](/generative-ai/github-copilot/docs/design-system/)
❌ 避けるべきアンチパターン¶
# 問題のある記述例
## 外部リソース依存(避けるべき)
- スタイルガイドは https://external-site.com/styleguide を参照
- 外部の my-org/my-repo リポジトリの styleguide.md に従う
## 曖昧な指示(避けるべき)
- 「フレンドリーな同僚のスタイルで回答」
- 「1000文字以内で回答」
- 「12文字以内の単語を使用」
## コンテキスト過多(避けるべき)
大量のコーディング規約、API仕様、設計ドキュメントを直接記述...
⚙️ VS Code設定とワークフロー統合¶
settings.json での追加設定(2026年2月版)¶
deprecated設定に注意
github.copilot.chat.codeGeneration.instructions は VS Code Docs で deprecated 扱いです。 基本は instruction files を使うことを推奨します。
推奨の記述(最小構成):
{
// .github/copilot-instructions.md を自動で取り込む
"github.copilot.chat.codeGeneration.useInstructionFiles": true,
// *.instructions.md の探索場所(デフォルトもこれ)
"chat.instructionsFilesLocations": {
".github/instructions": true
}
// ※ github.copilot.chat.codeGeneration.instructions は deprecated(原則使わない)
}
デフォルト設定
chat.instructionsFilesLocations のデフォルトは { ".github/instructions": true } です(VS Code設定リファレンス)。 instruction files が効かない時の切り分け(場所・設定)も VS Code Docs にまとまっています。
Git フックとの連携¶
#!/bin/sh
# .git/hooks/pre-commit
# カスタムインストラクションファイルの変更をチェック
if git diff --cached --name-only | grep -q "copilot-instructions.md"; then
echo "📝 Copilot instructions updated. Team notification recommended."
fi
🔧 よくある問題と解決策(2025年版)¶
❌ "Copilotがカスタムインストラクションを参照しない"¶
原因と解決策:
# 1. ファイル名・配置確認
ls -la .github/copilot-instructions.md
ls -la .github/instructions/*.instructions.md
# 2. YAML Frontmatter構文確認
# --- で囲まれているか、インデントが正しいか確認
# 3. ファイルサイズ確認(推奨: 2KB以下)
wc -c .github/copilot-instructions.md
❌ "複数の.instructions.mdファイルが機能しない"¶
2025年7月の新機能を使用:
# ファイル冒頭のYAML Frontmatterが必須
---
description: "説明文"
applyTo: "適用対象のglobパターン"
---
❌ "Referencesに表示されない"¶
確認手順: 1. VS Code Copilot Chat で質問 2. 「References」セクションを確認 3. ファイルが一覧に表示されない場合は構文エラーの可能性
❌ "チーム間で設定が異なる"¶
解決策:
# Git管理で設定統一
git add .github/copilot-instructions.md .github/instructions/
git commit -m "Standardize Copilot instructions across team"
# VS Code settings.json でも制御可能
{
"github.copilot.chat.codeGeneration.useInstructionFiles": true
}
🔍 効果測定と継続的改善(2025年版)¶
自動生成機能を活用した改善¶
# Copilotに改善提案を依頼
"@workspace Review and suggest improvements for our copilot-instructions.md based on recent code patterns"
# 定期的な見直しと更新(月1回推奨)
"@workspace Analyze recent commits and suggest updates to our custom instructions"
インストラクション効果の確認方法¶
- 参照確認: Copilot Chatの「References」セクション確認
- 応答品質: 生成コードが指示通りか定期評価
- チームフィードバック: 使用感の定期収集
継続的改善のプロセス¶
# インストラクション改善サイクル
## 月次レビュー
- [ ] Copilotによる改善提案の確認
- [ ] 新規技術・ツールの反映
- [ ] チームフィードバック収集
## 四半期レビュー
- [ ] プロジェクト方針変更の反映
- [ ] 複数.instructions.mdファイルの効果検証
- [ ] YAML Frontmatter設定の最適化
🎯 まとめ:効果的なカスタムインストラクション戦略¶
重要なポイント¶
- 簡潔性の維持: カスタムインストラクションファイル自体は簡潔に保ち、詳細は外部ドキュメントで管理
- 参照パターンの活用:
[file](path)や#file:path記法で効率的にドキュメント参照 - 人間とAI両方への最適化: 新人エンジニアが読んでも理解できる明確さ
- 段階的詳細レベル: 即座に必要な情報から詳細ガイドラインまで階層化
- 継続的改善: 定期的なレビューと更新でプロジェクトの変化に対応
実装優先度¶
- 基本セットアップ:
.github/copilot-instructions.mdの作成 - コアドキュメント: コーディング規約、デバッグガイドの整備
- 参照パターン: 外部ドキュメントへの効果的な参照設計
- チーム導入: 設定共有と使用方法の教育
- 継続改善: 定期レビューサイクルの確立
GitHub Copilotカスタムインストラクションは、単なる設定ファイルではなく、チーム開発の知識基盤を体系化する重要なツールです。適切に設計・運用することで、AI支援による開発効率化と品質向上を同時に実現できます。
❓ よくある質問 (FAQ)¶
Q: copilot-instructions.md はどの IDE からでも共有できますか?
はい、GitHub リポジトリの .github/ ディレクトリに配置するため、VS Code、Visual Studio、JetBrains IDEs など、GitHub Copilot がサポートする主要な IDE で共通して利用できます。
Q: .instructions.md はどの Copilot 機能で効きますか?
Copilot Chat および Agent Mode で有効です。インラインのコード補完(Ghost Text)には直接適用されませんが、Chat を通じたコード生成には強く影響します。
Q: 個人設定とリポジトリ設定はどちらが優先されますか?
基本的には両方のコンテキストが考慮されますが、競合する場合はユーザー個人の Custom Instructions 設定が優先される傾向にあります。ただし、リポジトリ固有のルールを強制したい場合は、チーム内で設定の同期を推奨します。
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